二、本案已超过诉讼时效
房管局于1993年7月26日颁发给A公司上述争议房屋的产权证。某公司在1995与A公司签订((拆迁安置补偿协议》时已知A公司取得了产权证，但在2004年11月才向法院提起诉讼，事情已间隔9年之久。根据当时施行的《最高人民法院关于执行<中华人民共和国行政诉讼法)若干问题的意见(试行)》第三十五条的规定，某公司的起诉期限最长不得超过1年。因此，本案中某公司的起诉已超过诉讼时效。
三、拆迁补偿应根据《拆迁安置补偿协议》办理
《城市房屋拆迁管理条例》第十三条规定“拆迁人与被拆迁人应当依照本条例的规定，就补偿方式和补偿金额、安置用房面积和安置地点、搬迁期限、搬迁过渡方式和过渡期限等事项，订立拆迁补偿安置协议。”本案涉及的有关重复补偿的问题，在拆迁时就应根据实际的权属状况进行补偿。A公司实际拥有拆迁范围内530平方米营业房的产权，按照《补偿安置协议》应得到补偿;B公司声称其拥有该530平方米营业房的所有权，但仅提供了房屋租赁证明，并无权属证明。根据《城市房屋权属登记管理办法》第五条的规定，“依法登记的房屋权利受国家法律保护”。B公司主张的房屋权利并未依法登记，故某公司无须向B公司进行拆迁补偿。
综上，某公司在拆迁前就应当弄清房屋的权利归属并进行补偿或者在补偿安置后，诉讼时效内提出拆迁补偿异议，而不是事隔9年已过诉讼时效后才提出。
提示：房屋产权证是房屋所有权人行使占有、使用、收益和处分的唯一合法凭证，依据房屋产权证理应获得补偿安置的权利，超过诉讼时效的不受法律保护。
