根据《劳动合同法》，他可以通过劳动仲裁维护自己的权益。
他可以要求单位签订无固定期劳动合同，补交相关社会保险，2008年1月1日以后的双倍工资。
住房公积金不属于强制保险，他无权主张。
现在仲裁的时效是1年。劳动仲裁2008年5月1日后免费。

申请劳动争议仲裁的时效是60天，自劳动争议发生之日开始计算。你所咨询和担心的是单位要追索你违约金，时效从何时开始计算？因为这种争议是由于你辞职（法律上叫作解除劳动合同），故应该从劳动合同解除之日开始计算。所以，从你解除劳动合同之日开始计算，但是问题是，如果你强行走人，而单位可以不认为你是解除劳动合同，是旷工。那单位可能反过来，将你除名,而单位从何时除名，合同担保 。单位可以自行掌握。追索你的违约金，可以从除名之日开始计算，也就是说如果单位有专业的律师指导，他完全可以规避时效的问题。而你要防止单位来这一招的方法，就是如何证明你已经解除了劳动合同？建议：写辞职报告，交给单位,但要证明你已经提交了辞职报告。因为劳动法规定，劳动者提前30日即可解除劳动合同。取得证据的方法可以是让单位领导签收你的辞职报告，或者找见证人，或者挂号邮寄等等。如果单位没有在你解除劳动合同后60日内提起仲裁索要违约金，那单位今后再追究你的违约责任，恐怕就过了时效了。当然你可以向单位要求转移档案，这个不受时效限制，当然你也可以在快到60日前申请仲裁。最后，还是建议你找专业人士指导一下。

好好看看今年1月施行的劳动合同法和今年5月施行的劳动争议仲裁法。
中国法律大全网站里面都有。