具体到纠纷原因，复瑛哲认为主要有:不及时按合同约定支付工程款、承包人施工工程质量达不到合同约定、合同价款争议、施工工期争议、工程结算争议等。

一、不及时按合同约定支付工程款，包括施工过程中不按约定进度款和竣工后不按约定支付工程结算款尾款。此类矛盾在改革开放后的市场经济发展过程中较为普遍，发包人资金不足或挪作他用，常常工程款不按时支付。复瑛哲认为，此类争议处理方法较简单，案理清晰，一方面是在合同中明确处理方式，新版合同文本中有专门条款，在此不再细述，横向关系经济纠纷。竣工后的结算尾款支付也有相应的处理方法，此类争议都会得到合理处理，山东省工伤保险条例。有法可依。最终以发包人支付工程款加上合理的利息补偿了结，很少有以留置工程拍卖，承包人优先受偿的处理方法。

二、工期延误纠纷的处理。建设工程施工合同在履行中发生迟延交付的原因很多，有勘察资料与地质情况不相符的原因，有设计方案的原因，有施工质量原因引起返工，有自然原因影响施工进度，也有发包人未按时拨付工程进度款、未按约供应建筑材料、未按时检验隐蔽工程或者及时组织竣工验收等。复瑛哲认为，建设工程逾期交付，如果是由于承包人责任造成，应按合同违约责任条款的约定，偿付逾期违约金;如果是发包人未能按照合同约定履行的，除顺延工期外，还应赔偿承包人因此产的实际损失。工程如果中途停止、待建或者由于设计变更以及设计错误造成返工，发包人应当赔偿承包人因停工、窝工、返工、倒运、人员和机械设备调迁、材料和构件积压等产生的实际损失。隐蔽工程在隐蔽前，横向关系经济纠纷。承包人应当通知发包人检查，发包人没有及时检查的，承包人可以顺延工期，并有权要求赔偿停工、窝工等造成的损失。领结婚证需要带什么。

三、工程质量瑕疵纠纷的处理。建设工程质量不符合合同约定的，承包人负责无偿修理或者返工，工程因此逾期交付的，偿付逾期违约金。工程质量造成使用人人身或者财产损失的，应承担赔偿责任以及其它法律责任。关于建设工程的保修期问题，合同法规定的为"合理期限"和"合理使用期限"。复瑛哲认为，所谓"合理期限"是指合同规定的保修期，而"合理使用期限"应为工程的设计使用的最低年限，也就是说，承包人在建筑物正常使用年限范围内，民间借贷纠纷调研。对建筑物质量负有终生的保证责任。

四、工程结算纠纷的处理。工程结算争议主要表现在合同履行期间由于市场材料价格变化、政策性费用调整引起合同价款的争议，合同约定了固定价格甚至约定了政策性调整也不调整结算价，承包人为了承揽到工程，不考虑市场行情变化而签下合同。对于此类争议的解决，复瑛哲建议，首先承包人从招标开始就应当慎重，一方面政策对承包人有相关保护性政策，承包人应学会保护自身的权益，另一方面应考虑到自身能不能规避此类风险，尽管最终通过诉讼总能找到争议双方能接受的调解结果，但是浪费了大量精力，最终即使得到补偿也可能会得不偿失。因此此类风险应在签订合同时就应当考虑到，在合同中加以规避，市场风险合理分担，免除以后的争议。