翻建房屋应该取得准建手续，以此才可办理房产证，注销原证。如果未办手续则不属于合法建筑。拆迁补偿，看是什么性质，如果政府公益拆迁补偿就有纠纷，开发商拆迁就好办些。一般情况下都给予了赔偿，要以平和的心态和拆迁单位协商，毕竟手续不完善。