增值税一般纳税人按照规定应该核算健全，能够准确核算销项税额、进项税额，也就是说在财务核算方面应该详细设置“应交税金——应交增值税——销项税额”、“应交税金——应交增值税——进项税额”、“应交税金——应交增值税——已交税额”、“应交税金——应交增值税——进项税额转出”、“应交税金——应交增值税——未交增值税（多交为负数）”等明细科目，同时掌握进项税额的抵扣范围，包括以下几个方面：
准予抵扣的进项税额：
1.从销售方取得的增值税专用发票上注明的增值税额；
2.从海关取得的完税凭证上注明的增值税额；
3.购进免税农产品准予抵扣的进项税额，按买价和规定的扣除率（13%）计算。
4.一般纳税人外购或销售货物（固定资产除外）所支付的运费，根据结算单据（普通发票）所列的运费金额，按7%的扣除率计算进项税额准予抵扣。
5.生产企业一般纳税人购入废旧物资回收经营单位的废旧物资，可按照普通发票上注明的金额，听说增值税纳税申报表。按10%计算抵扣进项税额。
增值税一般纳税人增值税申报程序：
1．认证。
纳税人取得防伪税控系统开具的增值税专用发票抵扣联，必须在纳税申报之前到所属区（分）局申报管理科“认证窗口”认证金税工程数据。税务机关认证后，向纳税人下达“认证结果通知书”和“认证结果清单”。对于认证不符及密文有误的抵扣联，税务机关暂不予抵扣，并当场扣留作调查处理。未经认证的，不得申报抵扣。
2．办理纳税申报。
(1) 纳税申报资料:
① 增值税纳税申报表;
② 工业企业增值税纳税申报销项、进项明细表；
③货物清单；
④增值税纳税申报表附列资料；
⑤发票领用存月报表；
⑥分支机构销售明细表；
⑦增值税（专用/普通）发票使用明细表；
⑧增值税（专用发票/海关完税凭证/收购凭证/运输发票）抵扣明细表；
⑨生产企业“免、抵、退”税计算明细表（实行出口货物“免、抵、退”税的企业提供）；
⑩税务机关规定的其他资料。
(2)备查资料及其保管。
①已开具的增值税专用发票存根联；
②已开具的普通发票存根联；
③符合抵扣条件并且在本期申报抵扣的增值税专用发票抵扣联；
④收购凭证(发票)的存根联或报查联；
⑤海关进口货物完税凭证的复印件；
⑥运输发票复印件（如果取得的运输发票数量较多，经主管税务机关批准可只附列单份票面金额在一定数额以上的运输发票复印件）；
⑦免税农产品的普通发票复印件、废旧物资回收企业开具的普通发票复印件;
⑧代扣代缴税款凭证存根联；
⑨进料加工申请表和来料加工免税证明单；
⑩主管税务机关规定的其他备查资料。
备查资料由纳税人在月度终了后，整理并装订成册。其中，①②④⑧项属于整本开具的应按原顺序装订；不属整本开具或开具电脑票的，应按开票顺序号码每25份装订一册，不足25份的按实际开具份数装订。对其他作为扣税凭证的单证，根据取得的时间顺序，按单证种类每25份装订一册，不足25份的按实际份数装订。以复印件作为备查资料的，应在复印件上注明原件的记账凭证册数字号。备查资料应按纳税申报办法的规定分类编号、装订成册，分册加装《增值税一般纳税人征税/扣税单证汇总簿封面》，按规定填写封面内容，纳税申报。由办税人员和财务人员审核签字，并按照《中华人民共和国税收征收管理法》有关规定保管，接受税务机关的检查。
（3）增值税纳税申报资料的填报要求。
纳税人按月申报纳税，于每月10日前到计划征收局征收科“申报征收窗口”办理纳税申报，并按相应的填表说明填报下列资料一式三份（认证通知书及其附列清单复印两份），加装《增值税一般纳税人增值税纳税申报资料汇总簿封面》后递交税务机关；税务机关对纳税申报资料的完整性审核后签收，将申报表录入电脑，在申报表上加盖“征收章”，一份退还纳税人，两份留存。对于各种纳税人报送申报资料的具体要求如下：
企业类型属商业企业的报送“纳税申报资料”第①、③、④、⑤、⑥、⑦、⑧、⑩项。
企业类型属工业企业的报送“纳税申报资料”第①、②、③、④、⑤、⑥、⑦、⑧、⑩项。其中实行“免抵退”税的纳税人须加送第⑨项。
货物单一、没有分支机构的不需要报送“纳税申报资料”第③、⑥项。
3．抄税。
纳税人每月将防伪税控开票系统中的数据抄至“税控IC卡”上，在办理完纳税申报手续的同时报给所属区（分）局申报管理科“抄税窗口”。“抄税窗口”抄税后，将“税控IC卡”退给纳税人。纳税人抄税数据大于申报表数据的，税务机关将暂扣“税控IC卡”，核实处理以后再退还给纳税人。纳税人必须在纳税申报的同时进行抄税，逾期抄税的，税务机关将暂停供应发票。