公司与分公司的债权债务关系

情况是这样的：分公司（主营小件货物快运业务）是某公司（管理挂靠车辆的运输公司）非独立核算的一个部门（没有营业执照），起初成立分公司是领导根据当前经营形式做出的安排，并抽调委派两名员工组建经营，后又安排1名财务和2个业务人员。由于种种原因，公司一直没有给分公司完善各类硬软件平台，如发货渠道、接货车等，只是告诉分公司会解决这些问题，先让我们租车和通过其他公司发货。这样一来成本增大了许多，为增加收入降低成本，在“经理”（也没有明文规定）的要求下我们用自行车、电动车去接货，没有叉车我们几个人去抬......,降低了些成本，同时广泛联系业务。到2009年底公司核算时，告诉我们分公司亏损2万多！公司把分公司的人员工资、福利奖金、业务费用、房租水电通通算上。我们同意这样的核算方式，然而事实上，分公司自2009年6月上旬成立以来，共产生营业收入近16万，毛利6万多。房租水电整个公司大院一年才6万，就让分公司承担2万！（1大间房子，股权融资和债权融资。连公司场地1/10都不到）；人员奖金福利发的是09年上半年的，那时还没有分公司！？甚至把公司承诺给客户的业务提成也算做分公司借款（按公司要求，分公司经营款项都是由经理和财务向公司借入的）...... 这样所有该核算的和不该核算的都算到分公司头上了，所以就亏损了（我们私下算过，除去不该核算到分公司的费用，最起码的利润也把分公司人员的工资顾住了）。这样的核算让我们很不安生，“经理”也多次找领导，让领导说明这些情况，亏损会不会让分公司或那个人承担。领导说这只是核算形式，不会让谁承担（并在领导班子会上也明确了，但没有会议纪要）。现在财务核算清楚了，要求“经理”在公司与分公司的债权债务交接单上签字（即分公司和公司间应交款，包括工资奖金（公司说是垫支给分公司的）和应收运费等），我们认为一旦签字，就意味着我们承认欠公司的钱，包括房租水电工资奖金都是公司代发的，这样一来我们不是成了债务人了，公司是债权人，公司随时可要找我们要钱？另，最近公司通知除正副经理（都没有文件规定谁是经理，只是领导说的）留在公司继续催收帐款，其余三人回家休息等公司通知。现在非要“经理”在债权债务上签字，“经理”担心自己会承担这些债务，有哪位高人指点一下，谢谢。
既然只是个部门，债券型基金。债权债务对外怎样说都是总公司的，公司按部门核算是可以的，尤其是单独的工程部门。好比家里3个儿子都挣钱，但老妈只让老大拿生活费，年底3个儿子往家里交钱自然老大就交的少了，但对外都是一个整体。其实这就是分公司的领导和你们大领导协调的问题，具体经营的好坏大领导应该有个分寸。
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