选C

《合同法》第一百一十六条：当事人既约定违约金，又约定定金的，一方违约时，对方可以选择适用违约金或者定金条款。所以，违约金与定金应当是选择适用的。本题应当选C。
　　分析：
　　如果选择违约金，则要退还甲公司给付的定金5000元，同时，还要给付甲公司违约金20万*5%=1万元。因为总共给乙公司造成损失2万元，所以，还要赔偿其损失1万元，总共需给甲公司2.5万。
　　如果选择定金，乙要先返还甲定金5000元，依据定金罚则再给其5000元，因为民法具有弥补损失的功能，但是不能让当事人从中受到的损害中获利，总共损失是2万元，最后得到的赔偿最多也只能是5000+5000+1.5万=2.5万元。               
　　所以，无论选择哪种赔偿，甲公司最多可得到2.5万元。